HR Excellence in Science
Datum: 19.02.2019

Objevili jsme dalších 7 nových virů

Sedm nových druhů virů objevili minulý rok pracovníci Ústavu molekulární biologie rostlin Biologického centra AV ČR. Objevené viry napadají jahody, jetel, třešně a rybíz, a výsledky výzkumu naznačují, že rozhodně nebudou mezi nově objevenými viry poslední.

  Moderní metody molekulární biologie umožňují řadu dříve nevídaných věcí. Třeba tzv. sekvenování nové generace (anglicky Next-generation sequencing) najednou “přečte” téměř veškerou dědičnou informaci obsaženou ve zkoumaném vzorku. Lze tak třeba relativně rychle zjistit, že vzorek obsahuje hned několik nových druhů virů. Sestavení jejich kompletní dědičné informace (virového genomu) je ale mravenčí práce a lepení posledních dílků skládačky a ověření přítomnosti viru dalšími technikami molekulární biologie je pak práce – v tom optimističtějším případě – na řadu týdnů.

  V roce 2018 se podařilo takovýchto virových “skládaček” složit pracovníkům Ústavu molekulární biologie rostlin hned sedm: čtyři nové druhy virů na jeteli, a po jednom pak na třešních, jahodách a rybízu (ten byl objeven ve spolupráci s kolegy z USA, Švýcarska, Slovinska a Belgie). Každý z virů patřil do jiné skupiny (rodu) virů, navíc některé z virů byly objeveny hned v několika různých verzích – například u viru z rybízu jich bylo pět. Aby toho nebylo málo, u dvou z nich bylo odhaleno, že vznikly zkřížením s jiným virem.

  Ačkoliv ani jeden z nich pravděpodobně žádné závažné onemocnění napadených rostlin nevyvolává, je dobré se těmito viry zabývat. Už jejich přítomnost v rostlinách ukazuje, že virový svět je daleko rozmanitější, než jsme si mysleli, a ty druhy, které dosud známe, tvoří určitě méně než onu pověstnou “špičku ledovce”. Objev více různých virových variant a zkřížených virů pak umožňuje zjistit, jak se viry vlastně vyvíjejí, jak vznikají nové, což nám může v budoucnu pomoci k nalezení způsobu, jak před viry lépe chránit nejen úrodu, ale třeba i člověka.

 

Publikace:

    • Koloniuk I., Fránová J. (2018) Complete nucleotide sequence and genome organization of red clover associated virus 1 (RCaV1), a putative member of the genus Waikavirus (family Secoviridae, order Picornavirales) Archives of Virology 163 (12): 3447–3449. DOI: 10.1007/s00705-018-4005-5
    • Koloniuk I., Fránová J., Sarkisová T., Přibylová J. (2018) Complete genome sequences of two divergent isolates of strawberry crinkle virus coinfecting a single strawberry plantArchives of Virology 163 (9) : 2539–2542. DOI: 10.1007/s00705-018-3860-4
    • Koloniuk I., Fránová J., Sarkisová T., Přibylová J., Lenz O., Petrzik K., Špak J. (2018) Identification and molecular characterization of a novel varicosa-like virus from red cloverArchives of Virology 163 (8): 2213–2218. DOI: 10.1007/s00705-018-3838-2
    • Koloniuk I., Přibylová J., Fránová J. (2018) Molecular characterization and complete genome of a novel nepovirus from red clover Archives of Virology 163: 1387–1389. DOI: 10.1007/s00705-018-3742-9
    • Koloniuk I., Sarkisová T., Petrzik K., Lenz O., Přibylová J., Fránová J., Špak J., Lotos L., Beta Ch., Katsiani A., Candresse T., Maliogka V.I. (2018) Variability Studies of Two Prunus-Infecting Fabaviruses with the Aid of High-Throughput Sequencing Viruses 10 (4): 204. DOI: 10.3390/v10040204
    • Koloniuk I., Thekke-Veetil T., Reynard J.S., Pleško I.M., Přibylová J., Brodard J., Kellenberger I., Sarkisová T., Špak J., Lamovšek J., Massart S., Ho T., Postman J.D., Tzanetakis I.E. (2018) Molecular Characterization of Divergent Closterovirus Isolates Infecting Ribes Species Viruses 10 (7): 369. DOI: 10.3390/v10070369
    • Lenz O., Sarkisová T., Koloniuk I., Fránová J., Přibylová J., Špak J. (2018) Red clover-associated luteovirus – a newly classifiable member of the genus Luteovirus with an enamo-like P5 protein Archives of Virology 163 (12): 3439–3442. DOI: 10.1007/s00705-018-3997-1

Zpět

 

KONTAKT

Biologické centrum AV ČR, v.v.i.
Branišovská 1160/31
370 05 České Budějovice
Datová schránka: r84nds8

 

+420 387 775 111 (ústředna)
+420 387 775 051 (sekretariát)
+420 778 468 552 (pro média)

NAJÍT PRACOVNÍKA

Biologické centrum Google mapa

Přihlášení do intranetu

Pro přihlášení do intranetu zadejte Vaše přihlašovací údaje

×