Gigantické genomy rostlin vznikají hromaděním repetitivní DNA a její přeměnou na “temnou hmotu”

Genom vyšších rostlin se mezi druhy liší více než 2000x. Velikost genomu přitom není úměrná počtu genů, ale je z velké části determinována rozdílným hromaděním tzv. repetitivní DNA. Naše studie odhalila mechanizmus vzniku gigantických genomů rostlin, spočívající v nižší účinnosti procesů odstraňování repetic a akumulaci mutací přeměňujících repetitivní elementy v „temmnou hmotu“. Ta již není rozeznávána jako repetitivní DNA, což umocňuje její hromadění v genomu. 

Vraní oko čtyřlisté (Paris quadrifolia)

Tato malá rostlinka nese v každé svojí buňce 20x více DNA než člověk. Přitom celkový počet genů je srovnatelný.

Publikace (bibliografický údaj):

Novak, P., Guignard, M.S., Neumann, P., Kelly, L.J., Mlinarec, J., Koblizkova, A., Dodsworth, S., Kovarik, A., Pellicer, J., Wang, W., Macas, J., Leitch, I.J., Leitch, A.R. (2020) – Repeat-sequence turnover shifts fundamentally in species with large genomes. Nature Plants 6:1325-1329.