HR Excellence in Science

MVDr. Kateřina Jirků, Ph.D.

Pomajbíková

Pracovní zařazení Vedoucí laboratoře - Laboratoř parazitární terapie
Veterinární a lékařská parazitologie
Parazitologický ústav

Kontaktní údaje +420-38-777-5470
pomajbikova@paru.cas.cz
126

Ostatní

Medailonek

Kateřina Jirků (Reseach ID: G-9858-2014) vede od roku 2013 vlastní výzkumnou laboratoř na Parazitologickém ústavu a ve své práci se zaměřuje na střevní eukaryotické organismy – především prvoky a helminty – a jejich roli v komplexním ekosystému střevního mikrobiomu. Dlouhodobě se věnuje zejména rodu Blastocystis a tasemnici Hymenolepis diminuta, jejich interakcím s mikrobiomem a hostitelským organismem i tomu, jak jejich výskyt a význam souvisejí s životním stylem a prostředím. Její výzkum tak přispívá k přehodnocování tradičního pohledu na organismy označované jako paraziti a ukazuje, že jejich vztah k hostiteli může být podstatně komplexnější.

Vystudovala veterinární lékařství a následně doktorský program ve veterinární parazitologii na Veterinární univerzitě v Brně. Vědě se začala věnovat již během studia, kdy výzkum parazitů a střevních symbiontů primátů propojila s terénní prací. V letech 2006–2012 opakovaně působila v Africe, kde pracovala s volně žijícími šimpanzi a gorilami, podílela se na vybudování diagnostické parazitologické laboratoře v rehabilitačním centru pro šimpanze v Keni a zapojila se také do projektu vakcinace psů proti vzteklině.

Po založení vlastní laboratoře postupně vybudovala mezinárodní výzkumný program propojující parazitologii, mikrobiologii, ekologii a výzkum střevního mikrobiomu. Významným milníkem bylo získání prestižního grantu Human Frontier Science Program v roce 2015 ve spolupráci s University of British Columbia (Co-I: Laura Wegener Parfrey), na který navázaly další národní i mezinárodní projekty. Jako hlavní řešitelka či spoluřešitelka dosud získala několik významných výzkumných grantů, financovaných mimo jiné Grantovou agenturou ČR, MŠMT a Norwegian Research Council. Současně rozvíjí dlouhodobé mezinárodní spolupráce s významnými pracovišti v Evropě, USA a Kanadě, mezi něž patří University of British Columbia, Duke University, University of Kent, University of Stavanger, Statens Serum Institut a U.S. Department of Agriculture.

Je autorkou či spoluautorkou 58 vědeckých publikací, z nichž 43 vyšlo v časopisech Q1 nebo Q2 a u 27 prací působila jako korespondenční nebo seniorní autorka. Mezi nejnovější výsledky jejího týmu patří také práce publikovaná v časopise Nature Communications. Za svůj vědecký přínos získala v roce 2018 Prémii Otto Wichterleho Akademie věd ČR a v roce 2024 se stala finalistkou programu L’Oréal–UNESCO Pro ženy ve vědě.


Vzdělání

  • 2008–2013 – Ph.D., veterinární parazitologie, Ústav patologické morfologie a parazitologie, Veterinární a farmaceutická univerzita Brno
  • 2001–2008 – MVDr., Fakulta veterinárního lékařství, Veterinární a farmaceutická univerzita Brno

Profesní zkušenosti

  • 2013–současnost – vedoucí výzkumné laboratoře, Parazitologický ústav, Biologické centrum AV ČR
  • 2017–2025 – vědecká a pedagogická pracovnice, Katedra medicínské biologie, Přírodovědecká fakulta, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
  • 2009–2013 – juniorní vědecká pracovnice, Ústav patologické morfologie a parazitologie, Veterinární a farmaceutická univerzita Brno

Vědecká ocenění

  • 2024 – finalistka programu L’Oréal–UNESCO Pro ženy ve vědě
  • 2018 – Prémie Otto Wichterleho Akademie věd ČR pro vynikající mladé vědecké pracovníky

Výzkumné zaměření

Výzkum Kateřiny se pohybuje na pomezí parazitologie, mikrobiologie, ekologie a výzkumu střevního mikrobiomu a zaměřuje se především na střevní eukaryotické organismy a jejich vztah k hostiteli. Hlavní oblasti jejího výzkumu zahrnují:

  • ekologii, diverzitu a epidemiologii střevních prvoků, zejména Blastocystis a Dientamoeba fragilis
  • roli střevních eukaryotických symbiontů – prvoků a helmintů – ve zdraví a onemocnění hostitele
  • interakce střevních eukaryot s bakteriálním mikrobiomem a jejich vliv na fungování střevního ekosystému
  • vliv životního stylu a prostředí na diverzitu a složení střevního mikrobiomu a eukaryomu
  • imunomodulační a protizánětlivé působení střevních helmintů a mechanismy jejich interakce s hostitelem
  • ekologii, genetickou variabilitu, hostitelskou specificitu a zoonotický potenciál střevních parazitů u lidí, primátů a dalších zvířat

(Research ID: G-9858-2014)


Celkem nalezeno: 58 záznamů
Jirků M., Parker W., Kadlecová O., Moos M., Wisniewska M., Kuchta R., Tláskalová P., Ilík V., Tomčala A., Pavlíčková Z., Brožová K., Lukeš J., Oborník M., Kolísko M., Pafčo B., Jirků K. (2026) Developmental plasticity enables intestinal tapeworm to adapt to dietary stress. Nature Communications 17: 2985.
DOI: 10.1038/s41467-026-69475-0

Dokumenty ke stažení:
Jirku_2026_NatComm (pdf)
Pavlíčková Z., Jirků K., Zimmelová E., Hurtado L.H., Gentekaki E., Tsaousis A. (2026) Blastocystis in domestic mammals and poultry: from prevalence patterns to gut physiology. Trends in Parasitology 42: 127–137.
DOI: 10.1016/j.pt.2025.12.001
Venkatakrishnan A., Swanson C., Palkar A., Takamiya D., Sarafian J.T., Mauney J., Gatongi M.W., Cendejas Hernandez J., Lawton V., Holzknecht Z.E., Jones III J.P., Konsoula Z., Jirků K., Aglietii G., Goj D., Parker W. (2026) Isolation of Hymenolepis diminuta cystocercoids for therapeutic use: The need for open-source methodology. F1000 Research 15: 1334.
DOI: 10.12688/f1000research.186809.1
Brožová K., Šejnohová A., Koutenská Koutenská, Pavlíčková Z., Jirků M., Zimmelová E., Kadlecová O., Petrželková K. J., Jirků K. (2025) Epidemiology of Giardia intestinalis in non-human primates and their caregivers: A study from Czech zoos One Health 21: 101176.
DOI: 10.1016/j.onehlt.2025.101176
Mazanec H., Koník P., Bušková N., Kyslík J., Gardian Z., Bílý T., Jirků K., Kuchta R. (2025) Insights into extracellular vesicle biogenesis and secretion of the tapeworm Hymenolepis diminuta: Host interaction and cultivation dynamics International Journal for Parasitology 55: 69–77.
DOI: doi.org/10.1016/j.ijpara.2024.11.005
Pavlíčková Z., Pafčo B., Ilík V., Anderssen L. OB., Jirků M., Brožová K., Modrý D., Kadlecová O., Stensvold C., Jirků K. (2025) Shaping the human gut microbiota: The role of canine companionship, lifestyle choices, and Blastocystis sp. One Health 20: 100979.
DOI: 10.1016/j.onehlt.2025.100979
Shaw D., Denoyelle C., Tan K.S.W., Clark C.G., Yoskikawa H., Viscogliosi E., Gentekaki E., Jirků K., Tsaousis A. (2025) Comprehensive tools for culturing Blastocystis: A standardized resource for research and diagnostics. Current Protocols 5: e70175.
DOI: 10.1002/cpz1.70175
Tsaousis A., Shaw D., Jirků K., Carmena D., Gentekaki E. (2025) Rethinking Blastocystis: Ubiquity and cyclical abundance in the human gut. Trends in Parasitology 41: 954–958.
DOI: 10.1016/j.pt.2025.08.009
Uwamahoro C., Holubová N., Jirků M., Sak B., Květoňová D., Samaš P., Červená B., Romportl D., Eckard W., Ndagijimana F., Muvunyi R., Uwingeli P., Mapilanga J., Aruho R., Cranfield M., Gilardi K., Nziza J., Ssebide B., Syaluha E.K., Pafčo B., Jirků K., Kváč M., Petrželková K. J. (2025) Cryptosporidium, microsporidia and Giardia infections in endangered Mountain Gorillas inhabiting Virunga Massif. Journal of Vertebrate Biology 74: 25035.
DOI: 10.25225/jvb.25035
Parker W., Jirků K., Patel E., Williamson L., Anderson L., Laman J.D. (2024) Reevaluating biota alteration: refreaming environmental influences on chronic immune disorders and exploring novel therapeutic opportunities Yale Journal of Biology and Medicine 97: 253–263.
DOI: 10.59249/VUNF1315
Šejnohová A., Koutenská Koutenská, Jirků M., Brožová K., Pavlíčková Z., Kadlecová O., Cinek O., Maloney J.G., Santin M., Petrželková K. J., Jirků K. (2024) A cross-sectional survey of Blastocystis sp. and Dientamoeba fragilis in non-human primates and their caregivers in Czech zoos One Health 19: 100862.
DOI: 10.1016/j.onehlt.2024.100862
Brožová K., Jirků M., Lhotská Z., Květoňová D., Kadlecová O., Rune Stensvold C., Samaš P., Petrželková K. J., Jirků K. (2023) The Opportunistic Protist, Giardia intestinalis, Occurs in Gut-healthy Humans in a High-income Country Giardia intestinalis in gut-healthy humans Emerging Microbes and Infections 12: 2270077.
DOI: 10.1080/22221751.2023.2270077
Hurych J., Oscarsson E., Hakanson A., Jirků-Pomajbíková K., Jirků M., Aronson C.A., Cinek O., Arardh D., Hemimed I.Group (2023) Effects of Lactiplantibacillus plantarum and Lacticaseibacillus paracasei supplementation on the sigle-cell faecal parasitome in children with celiac disease autoimmunity: a randomized, double-blind placebo-controlled clinical trial. Parasites and Vectors 16: 411.
DOI: 10.1186/s13071-023-06027-1
Nosková E., Modrý D., Baláž V., Červená B., Jirků-Pomajbíková K., Leowski C., Petrželková K. J., Pšenková-Profousová I., Vodička R., Kessler S.E., Ngoubangoye B. , Setchell J.M., Pafčo B. (2023) Identification of pontetially zoonotic parasites in captive orangutans and semi-captive mandrills: phylogeny and morphological comparison American Journal of Primatology 85: e23475.
DOI: 10.1002/ajp.23475
Parker W., Patel E., Jirků-Pomajbíková K., Laman J.D. (2023) COVID-19 morbidity in lower versus higher income populations underscores the need to restore lost biodiversity of eukaryotic symbionts iScience 26: 106167.
DOI: 10.1016/j.isci.2023.106167
Jirků M., Kašparová A., Lhotská Z., Oborník M., Brožová K., Petrželková K. J., Samaš P., Kadlecová O., Stensvold C., Jirků-Pomajbíková K. (2022) A cross-sectional study on the occurrence of the intestinal protist, Dientamoeba fragilis, in the gut-gealthy volunteers and their animals International Journal of Molecular Sciences 22: 15407.
DOI: 10.3390/ijms232315407
Šloufová M., Lhotská Z., Jirků M., Petrželková K. J., Stensvold C., Cinek O., Jirků-Pomajbíková K. (2022) Comparison of molecular diagnostic approaches for the detection and differentiation of the intestinal protist Blastocystis sp. in humans Parasite 29: 30.
DOI: 10.1051/parasite/2022029
Venkatakrishnan A., Sarafian J.T., Jirků-Pomajbíková K., Parker W. (2022) Socio-medical studies of individuals self-treating with helminths provide insight into clinical trial design for assessing helminth therapy Parasitology International 87: 102488.
DOI: 10.1016/j.parint.2021.102488
Billy V., Lhotská Z., Jirků M., Kadlecová O., Frgelecová L., Wegener Parfrey L., Jirků-Pomajbíková K. (2021) Blastocystis Colonization Alters the Gut Microbiome and, in Some Cases, Promotes Faster Recovery From Induced Colitis Frontiers in Microbiology 2: 641483.
DOI: 10.3389/fmicb.2021.641483
Jirků M., Lhotská Z., Frgelecová L., Kadlecová O., Petrželková K. J., Morien E., Jirků-Pomajbíková K. (2021) Helminth Interactions with Bacteria in the Host Gut Are Essential for Its Immunomodulatory Effect Microorganisms 9: 226.
DOI: 10.3390/microorganisms9020226

Více publikací

KONTAKT

Biologické centrum AV ČR, v.v.i.
Branišovská 1160/31
370 05 České Budějovice
Datová schránka: r84nds8

 

+420 387 775 111 (ústředna)
+420 387 775 051 (sekretariát)
+420 778 468 552 (pro média)

NAJÍT PRACOVNÍKA

Biologické centrum Google mapa

Přihlášení do intranetu

Pro přihlášení do intranetu zadejte Vaše přihlašovací údaje

×