Chmelová L., Záhonová K., Albanaz A.T.S., Hrebenyk L., Horváth A., Yurchenko V.,
Škodová-Sveráková I. (2024) Distribution and functional analysis of isocitrate dehydrogenases across kinetoplastids Genome Biology and Evolution
16: evae042.
DOI: 10.1093/gbe/evae042
|
Opperdoes F.R., Záhonová K.,
Škodová-Sveráková I., Bučková B., Chmelová L.,
Lukeš J., Yurchenko V. (2024) In silico prediction of the metabolism of Blastocrithidia nonstop, a trypanosomatid with non-canonical genetic code BMC Genomics
25: 184.
DOI: 10.1186/s12864-024-10094-8
Dokumenty ke stažení:
Opperdoes_2024_BMCGenom (pdf)
|
Albanaz A.T.S., Carrington M., Frolov A., Ganyukova A., Gerasimov E.S.,
Lukeš J., Malysheva M.,
Votýpka J., Zakharova A., Záhonová K., Zimmer S., Yurchenko V.,
Butenko A. (2023) Shining the spotlight on the neglected: new high-quality genome assemblies as a gateway to understanding the evolution of Trypanosomatidae BMC Genomics
24: 471.
DOI: 10.1186/s12864-023-09591-z
Dokumenty ke stažení:
Albanaz_2023 (pdf)
|
Barlow L.D., Maciejowski W., More K., Terry K., Vargová R., Záhonová K., Dacks J. (2023) Comparative Genomics for Evolutionary Cell Biology Using AMOEBAE: Understanding the Golgi and Beyond In: Y. Wang, V.V. Lupashin, T.R. Graham (Eds), Golgi, Methods in Molecular Biology. Humana Press, New York
2557: 431–452.
DOI: 10.1007/978-1-0716-2639-9_26
|
Faktorová D., Záhonová K.,
Benz C.,
Dacks J.,
Field M.,
Lukeš J. (2023) Functional differentiation of Sec13 paralog in the euglenozoan protists Open Biology
13: 220364.
DOI: 10.1098/rsob.220364
Dokumenty ke stažení:
Faktorova_2023_OpenBiol (pdf)
|
Kachale A., Pavliková Z.,
Nenarokova A., Roithová A.,
Durante I., Miletínová P., Záhonová K.,
Nenarokov S.,
Votýpka J.,
Horáková E., Ross R.L., Yurchenko V., Beznosková P.,
Paris Z., Valášek L.S.,
Lukeš J. (2023) Short tRNA anticodon stem and mutant eRF1 allow stop codon reassignment Nature
613: 751–758.
DOI: 10.1038/s41586-022-05584-2
Dokumenty ke stažení:
Kachale_2023_Nature (pdf)
|
Macedo D.H., Grybchuk D., Režnarová J.,
Votýpka J., Klocek D., Yurchenko T., Ševčík J., Magri A., Dolinská M.U., Záhonová K.,
Lukeš J., Servienė E., Jászayová A., Serva S., Malysheva M., Frolov A., Yurchenko V., Kostygov A. (2023) Diversity of RNA viruses in the cosmopolitan monoxenous trypanosomatid Leptomonas pyrrhocoris BMC Biology
21: 191.
DOI: 10.1186/s12915-023-01687-y
Dokumenty ke stažení:
Macedo_2023_BMCBiol (pdf)
|
Sheikh S., Pánek T.,
Gahura O.,
Týč J., Záhonová K.,
Lukeš J., Eliáš M.,
Hashimi H. (2023) A novel group of dynamin-related proteins shared by eukaryotes and giant viruses is able to remodel mitochondria from within the matrix Molecular Biology and Evolution
40: msad134.
DOI: 10.1093/molbev/msad134
Dokumenty ke stažení:
Sheikh_2023_MolBiolEvol (pdf)
|
Záhonová K., Low R.S., Warren C.J., Cantoni D., Herman E., Yiangou L., Ribeiro C.A., Phanprasert Y., Brown I.R., Rueckert S., Baker N.L., Tachezy J., Betts E.L., Gentekaki E., van der Giezen M., Clark C.G., Jackson A.,
Dacks J., Tsaousis A. (2023) Evolutionary analysis of cellular reduction and anaerobicity in the hyper-prevalent gut microbe Blastocystis Current Biology
33: 2449–2464.
DOI: 10.1016/j.cub.2023.05.025
|
Záhonová K., Valach M.,
Tripathi P.,
Benz C., Opperdoes F.R., Baráth P., Lukáčová V., Danchenko M.,
Faktorová D., Horváth A., Burger G.,
Lukeš J.,
Škodová-Sveráková I. (2023) Subunit composition of mitochondrial dehydrogenase complexes in diplonemid flagellates Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects
1867: 130419.
DOI: 10.1016/j.bbagen.2023.130419
Dokumenty ke stažení:
Zahonova_2023_BBA (pdf)
|
Tashyreva D., Simpson A.,
Prokopchuk G.,
Škodová-Sveráková I.,
Butenko A.,
Hammond M., George E.E.,
Flegontova O., Záhonová K.,
Faktorová D., Yabuki A.,
Horák A., Keeling P.,
Lukeš J. (2022) Diplonemids - A Review on "New" Flagellates on the Oceanic Block Protist
173: 125868.
DOI: 10.1016/j.protis.2022.125868
Dokumenty ke stažení:
Tashyreva_2022_Protist (pdf)
|
Záhonová K., Treitli S.C.,
Škodová-Sveráková I., Hanousková P., Čepička I., Tachezy J., Hampl V. (2022) Anaerobic derivates of mitochondria and peroxisomes in the free-living amoeba Pelomyxa schiedti revealed by single-cell genomics BMC Biology
20: 56.
DOI: 10.1186/s12915-022-01247-w
Dokumenty ke stažení:
Zahonova_2022_BMCBiol (pdf)
|
Zimmann N., Rada P., Žárský V., Smutná T., Záhonová K.,
Dacks J., Harant K., Hrdý I., Tachezy J. (2022) Proteomic analysis of Trichomonas vaginalis phagolysosome, lysosomal targeting, and unconventional secretion of cysteine peptidases Molecular and Cellular Proteomics
21: 100174.
DOI: 10.1016/j.mcpro.2021.100174
Dokumenty ke stažení:
Zimmann_2022_ MCP (pdf)
|
Herman E., Greninger A., van der Giezen M., Ginger M., Ramirez-Macias I., Miller H.C., Morgan M.J., Tsaousis A., Velle K., Vargová R., Záhonová K., Najle S.R., MacIntyre G., Muller N., Wittwer M., Zysset-Burri D.C., Eliáš M., Slamovits C., Weirauch M., Fritz-Laylin L., Marciano-Cabra F., Puzon G.J., Walsh T., Chiu C.,
Dacks J. (2021) Genomics and transcriptomics yields a 1 systems-level view of the biology of the pathogen Naegleria fowleri BMC Biology
19: 142.
DOI: 10.1186/s12915-021-01078-1
Dokumenty ke stažení:
Herman_2021_BMC_Biology (pdf)
|
Poláková E., Záhonová K., Albanaz A.T.S.,
Butenko A.,
Lukeš J., Yurchenko V. (2021) Diverse telomeres in trypanosomatids Parasitology
148: 1254–1270.
DOI: 10.1017/S0031182021000378
Dokumenty ke stažení:
Polakova_2021_Parasitology (pdf)
|
Škodová-Sveráková I., Záhonová K.,
Juricová V., Danchenko M.,
Moos M., Baráth P.,
Prokopchuk G.,
Butenko A., Lukáčová V., Kohútová L., Bučková B.,
Horák A.,
Faktorová D., Horváth A.,
Šimek P.,
Lukeš J. (2021) Highly flexible metabolism of the marine euglenozoan protist /Diplonema papillatum/. BMC Biology
19: 251.
DOI: 10.1186/s12915-021-01186-y
Dokumenty ke stažení:
Skodova-Sverakova_2021_BMCBiol (pdf)
|
Záhonová K., Lax G., Sinha S., Leonard G., Richards T.,
Lukeš J., Wideman J.G. (2021) Single-cell genomics unveils a canonical origin of the diverse mitochondrial genomes of euglenozoans BMC Biology
19: 103.
DOI: 10.1186/s12915-021-01035-y
Dokumenty ke stažení:
Zahonova_2021_BMC_Biology (pdf)
|
Füssy Z., Záhonová K.,
Tomčala A., Krajčovič J., Yurchenko V.,
Oborník M., Eliáš M. (2020) The Cryptic Plastid of Euglena longa Defines a New Type of Nonphotosynthetic Plastid Organelle mSphere
5: e00675-20.
DOI: 10.1128/mSphere.00675-20
Dokumenty ke stažení:
Fussy_2020_mSphere (pdf)
|
Kaur B., Záhonová K., Valach M.,
Faktorová D.,
Prokopchuk G., Burger G.,
Lukeš J. (2020) Gene fragmentation and RNA editing without borders: eccentric mitochondrial genomes of diplonemids Nucleic Acids Research
48: 2694–2708.
DOI: 10.1093/nar/gkz1215
Dokumenty ke stažení:
Kaur_2020_Nucleic Acids Research (pdf)
|
Novák Vanclová A.M.G., Zoltner M., Kelly S., Soukal P., Záhonová K.,
Füssy Z., Ebenezer T.E.,
Lacová Dobáková E., Eliáš M.,
Lukeš J.,
Field M., Hampl V. (2020) Metabolic quirks and the colourful history of the Euglena gracilis secondary plastid New Phytologist
225: 1578–1592.
DOI: 10.1111/nph.16237
Dokumenty ke stažení:
Vanclova_2020_NewPhytologist (pdf)
|
