HR Excellence in Science

Mgr. Aleš Horák, Ph.D.

Pracovní zařazení Vedoucí laboratoře - Laboratoř environmentální genomiky
Molekulární parazitologie
Parazitologický ústav

Kontaktní údaje +420 387775409
ogar@paru.cas.cz
PARU II

Ostatní

Více informací v anglické verzi.


Výuka Úvod do Bioinformatiky / Introduction to Bioinformatics
Přírodovědecká fakulta Jihočeské univerzity / Faculty of Science University of South Bohemia

Úvod fo genomiky / Introduction to Genomics
Přírodovědecká fakulta Jihočeské univerzity / Faculty of Science, University of South Bohemia

Celkem nalezeno: 50 záznamů
Prokopchuk G., Korytář T., Juricová V., Majstorović J., Horák A., Šimek K., Lukeš J. (2022) Trophic flexibility of marine diplonemids - switching from osmotrophy to bacterivory The ISME Journal 16: 1409–1419.
DOI: 10.1038/s41396-022-01192-0

Dokumenty ke stažení:
Prokopchuk_2022_ISMEJ (pdf)
Tashyreva D., Simpson A., Prokopchuk G., Škodová-Sveráková I., Butenko A., Hammond M., George E.E., Flegontova O., Záhonová K., Faktorová D., Yabuki A., Horák A., Keeling P., Lukeš J. (2022) Diplonemids - A Review on "New" Flagellates on the Oceanic Block Protist 173: 125868.
DOI: 10.1016/j.protis.2022.125868

Dokumenty ke stažení:
Tashyreva_2022_Protist (pdf)
Barcytė D., Eikrem W., Engesmo A., Seoane S., Wohlmann J., Horák A., Yurchenko T., Eliáš M. (2021) Olisthodiscus represents a new class of Ochrophyta Journal of Phycology 57: 1094–1118.
DOI: 10.1111/jpy.13155
Škodová-Sveráková I., Záhonová K., Juricová V., Danchenko M., Moos M., Baráth P., Prokopchuk G., Butenko A., Lukáčová V., Kohútová L., Bučková B., Horák A., Faktorová D., Horváth A., Šimek P., Lukeš J. (2021) Highly flexible metabolism of the marine euglenozoan protist /Diplonema papillatum/. BMC Biology 19: 251.
DOI: 10.1186/s12915-021-01186-y

Dokumenty ke stažení:
Skodova-Sverakova_2021_BMCBiol (pdf)
Turnšek J., Brunson J.K., Viedma M.D.P.M., Deerinck T.J., Horák A., Oborník M., Bielinski V.A., Allen A.E. (2021) Proximity proteomics in a marine diatom reveals a putative cell surface-to-chloroplast iron trafficking pathway eLife 10: e52770.
DOI: 10.7554/eLife.52770
Butenko A., Opperdoes F.R., Flegontova O., Horák A., Hampl V., Keeling P., Gawryluk R., Tikhonenkov D.V., Flegontov P., Lukeš J. (2020) Evolution of metabolic capabilities and molecular features of diplonemids, kinetoplastids, and euglenids BMC biology 18: 23.
DOI: 10.1186/s12915-020-0754-1

Dokumenty ke stažení:
Butenko_BMC-Biology_2020 (pdf)
Flegontova O., Flegontov P., Castaňeda Londoňo P., Walczowski W., Śantić D., Edgcomb V., Lukeš J., Horák A. (2020) Environmental determinants of the distribution of planktonic diplonemids and kinetoplastids in the oceans Environmental Microbiology 22: 4014–4031.
DOI: 10.1111/1462-2920.15190

Dokumenty ke stažení:
Flegontova_2020_EnvMicrob (pdf)
George E.E., Husník F., Tashyreva D., Prokopchuk G., Horák A., Kwong W.K., Lukeš J., Keeling P. (2020) Highly Reduced Genomes of Protist Endosymbionts Show Evolutionary Convergence Current Biology 30: 925-933.
DOI: 10.1016/j.cub.2019.12.070

Dokumenty ke stažení:
George_2020_CurrentBiology (pdf)
Horák A., Allen A.E., Oborník M. (2020) Common origin of ornithine–urea cycle in opisthokonts and stramenopiles Scientific Reports 10: 16687.
DOI: 10.1038/s41598-020-73715-8
Kolísko M., Flegontova O., Karnkowska A., Lax G., Maritz J.M., Pánek T., Táborský P., Carlton J.M., Čepička I., Horák A., Lukeš J., Simpson A., Tai V. (2020) EukRef-excavates: seven curated SSU ribosomal RNA gene databases Database 2020: baaa080.
DOI: 10.1093/database/baaa080

Dokumenty ke stažení:
Kolisko_2020_Database (pdf)
Smýkal V., Pivarči M., Provazník J., Bazalová O., Jedlička P., Lukšan O., Horák A., Vaněčková H., Beneš V., Fiala I., Hanus R., Doležel D. (2020) Complex evolution of insect insulin receptors and homologous decoy receptors, and functional significance of their multiplicity. Molecular Biology and Evolution 37: 1775-1789.
DOI: 10.1093/molbev/msaa048
Coale T.H., Moosburner M., Horák A., Oborník M., Barbeau K.A., Allen A.E. (2019) Reduction-dependent siderophore assimilation in a model pennate diatom Proceedings of the National Academy of Sciences of United States of America 116: 23609-23617.
DOI: 10.1073/pnas.1907234116
Prokopchuk G., Tashyreva D., Yabuki A., Horák A., Masařová P., Lukeš J. (2019) Morphological, ultrastructural, motility and evolutionary characterization of two new Hemistasiidae species Protist 170: 259–282.
DOI: 10.1016/j.protis.2019.04.001

Dokumenty ke stažení:
Prokopchuk et al._2019_Protist (pdf)
Smith S.R., Dupont C.L., McCarthy J.K., Boddrick J.T., Oborník M., Horák A., Füssy Z., Cihlář J., Kleessen S., Zheng H., McCrow J.P., Hixson K.K., Araújo W.L., Nunes-Nesi A., Fernie A., Nikoloski Z., Palsson B.O., Allen A.E. (2019) Evolution and regulation of nitrogen flux through compartmentalized metabolic networks in a marine diatom Nature Communications 10: 4552.
DOI: 10.1038/s41467-019-12407-y
Faktorová D., Bär A., Hashimi H., McKenney K., Horák A., Schnaufer A., Rubio M., Alfonzo J., Lukeš J. (2018) TbUTP10, a protein involved in early stages of pre-18S rRNA processing in Trypanosoma brucei Molecular and Biochemical Parasitology 225: 84–93.
DOI: 10.1016/j.molbiopara.2018.09.003

Dokumenty ke stažení:
Faktorova_et al._2018 (pdf)
Flegontova O., Flegontov P., Malviya S., Poulain J., de Vargas C., Bowler C., Lukeš J., Horák A. (2018) Neobodonids are dominant kinetoplastids in the global ocean Environmental Microbiology 20: 878-889.
DOI: 10.1111/1462-2920.14034

Dokumenty ke stažení:
Flegontova_et.al_2018 (pdf)
McQuaid J.B., Kustka A.B., Oborník M., Horák A., Mccrow J., Karas B.J., Zheng H., Kindeberg T., Andersson A.J., Barbeau K.A., Allen A. (2018) Carbonate-sensitive phytotransferrin controls high-affinity iron uptake in diatoms Nature 555: 534-537.
DOI: 10.1038/nature25982
Tashyreva D., Prokopchuk G., Votýpka J., Yabuki A., Horák A., Lukeš J. (2018) Life cycle, ultrastructure, and phylogeny of new diplonemids and their endosymbiotic bacteria mBio 9: e02447-17.
DOI: 10.1128/mBio.02447-17

Dokumenty ke stažení:
Tashyreva et al. 2018 mBio (pdf)
Tashyreva D., Prokopchuk G., Yabuki A., Kaur B., Faktorová D., Votýpka J., Kusaka Ch., Fujikura K. , Shiratori T., Ishida K., Horák A., Lukeš J. (2018) Phylogeny and morphology of new diplonemids from Japan Protist 169: 158–179.
DOI: 10.1016/j.protis.2018.02.001

Dokumenty ke stažení:
Tashyreva_et.al_Protist_2018 (pdf)
Rueckert S., Horák A. (2017) Archigregarines of the English Channel revisited: new molecular data on Selenidium species including early described and new species and the uncertainties of phylogenetic relationships Plos ONE 12: e0187430.
DOI: 10.1371/journal.pone.0187430

Více publikací

KONTAKT

Biologické centrum AV ČR, v.v.i.
Branišovská 1160/31
370 05 České Budějovice
Datová schránka: r84nds8

 

+420 387 775 111 (ústředna)
+420 387 775 051 (sekretariát)
+420 778 468 552 (pro média)

NAJÍT PRACOVNÍKA

Biologické centrum Google mapa

Přihlášení do intranetu

Pro přihlášení do intranetu zadejte Vaše přihlašovací údaje

×